
關(guān)于線粒體的系列文章,有朋友說專業(yè)太強(qiáng)了,不好懂,盡管如此,這些文章的閱讀量仍然能過千次,說明總有一些人能看懂,當(dāng)然也有一些朋友即使不懂也堅持看下去的。為了能讓大家對線粒體系列有更好理解,這里我對線粒體進(jìn)行一些白話解釋。
我們的細(xì)胞維持功能需要不斷消耗能量,細(xì)胞能量來自對能量營養(yǎng)素分解產(chǎn)生的化學(xué)能。能量營養(yǎng)素就是我們吃的糖脂肪和蛋白質(zhì)等,這些物質(zhì)類似汽車的汽油,汽車消耗汽油是用燃燒的方法,但我們的細(xì)胞沒有汽缸,只有利用酶的催化一步步對這些能量化合物進(jìn)行分解,一邊分解一邊把能量變成可使用的化學(xué)能小分子ATP。我們可以理解為這些ATP就是電池,可以驅(qū)動細(xì)胞內(nèi)的各種工作,例如肌肉運動,神經(jīng)放電,合成DNA分子等工作。線粒體就是一個ATP電池制造廠,不斷提取營養(yǎng)物質(zhì)的化學(xué)能制造這種小電池。這個過程非常神奇,先從能量物質(zhì)的提取高能級電子,然后利用電子能級的下降經(jīng)過細(xì)胞膜電的驅(qū)動合成ATP,雖然ATP仍然是化學(xué)能,但線粒體合成ATP過程真是利用的電能。我們將的線粒體復(fù)合物I就是一種利用高能電子轉(zhuǎn)移質(zhì)子,制造細(xì)胞化學(xué)能的最典型代表。
關(guān)鍵的關(guān)鍵是,這個復(fù)合物I和氫氣代謝的氫化酶就是一家人,所以這才引起我們的重視。氫氣曾經(jīng)是低等生物的能量轉(zhuǎn)化樞紐,能量轉(zhuǎn)化的分子介質(zhì)就是氫化酶,這分子能合成氫氣,也能分解氫氣。作用線粒體復(fù)合物I這種氫化酶的后代,代謝氫氣的潛力應(yīng)該仍然存在。
今天是線粒體和氫化酶進(jìn)化故事的最后一個內(nèi)容了,感謝大家的持續(xù)支持。今天的內(nèi)容主要從化學(xué)原理上解釋了氫氣完全具有給線粒體提供電子的可能性。因為氫氣作為還原底物,擁有還原輔酶Q張力,且能釋放足夠能量,這是反應(yīng)可以持續(xù)的基礎(chǔ)。
2H+/H2的中點氧化還原電位大約+420mV,Q/QH2大約+90 mV,N2簇(pH 依賴: -59 mV/pH)大約為(-150)-(-250) mV。半醌陰離子和醌陰離子轉(zhuǎn)化的同時給質(zhì)子泵提供能量,從熱力學(xué)角度看,氫氣激活能給穩(wěn)定的醌分子提供氧化還原能。這種情況下,質(zhì)子泵可重新被激活。半醌Em=(-200)~(-300) mV,氫氣分子具有給半醌等提供電子的潛力。醌負(fù)離子脫質(zhì)子的分解常數(shù)估計為2 x 10-13 M。作為質(zhì)子接受體醌陰離子有激活氫氣的潛力,半醌陰離子則能作為親電子,也能作為親質(zhì)子分子。堿性殘基(如His59)能吸引質(zhì)子;在醌的擠壓作用下,Thy108相關(guān)親電子N2簇也能極化和激活氫氣。氫氣給醌分子轉(zhuǎn)移電子的可能性有多種,醌Q、半醌陰離子Q•-、質(zhì)子化半醌Q•H和醌陰離子QH-等。H+-base代表親質(zhì)子堿性基如His59和,N2ox-e-代表接受電子的氧化N2簇。
氫氣轉(zhuǎn)移電子給Q:
Q + H2 → Q•-+ H+-base + H•→ Q•H + H+-base + e-→QH- + H+- base→ QH2 (1)
氫氣轉(zhuǎn)移電子給Q•-
Q•- +H2 → Q2- + H+-base + N2ox-e-+H+→QH- + H+-base + N2 red→ QH2 + N2 red (2)
氫氣轉(zhuǎn)移質(zhì)子到Q•-
Q•- +H2 → Q•H + N2ox -e- + H+-base + e- → QH-+ N2 red + H+-base→ QH2 + N2 red (3)
氫氣轉(zhuǎn)移電子給 Q•H
Q•H +H2 → QH- + H+-base + N2ox -e- + H+ → QH2 + N2red + H+-base (4)
氫氣轉(zhuǎn)移質(zhì)子給QH-
QH- + H2 → QH2 + N2ox-e- + e- + H+-base → QH2 + N2 red + e-+H+-base (5)
反應(yīng)(1)需要周圍堿性基和親電子N2簇先激活氫氣。反應(yīng)(2)到(5)依賴于從電子的雙向傳遞,包括N2ox經(jīng)過N2red逆向給NAD+傳遞電子,從醌中間體向氫醌正向轉(zhuǎn)遞電子。在(1)、(2)和(4)反應(yīng)的第一步,氫氣作為還原劑和提供電子參與反應(yīng),在(3)和(5)反應(yīng)中,氫氣作為氧化劑提供質(zhì)子參與反應(yīng)。(3)和(5)反應(yīng)的多步驟機(jī)制中,可命名為氧化劑誘導(dǎo)的還原反應(yīng),這是復(fù)合物III發(fā)生的典型氧化還原反應(yīng)。
開始,氫氣作為質(zhì)子提供者和氧化劑和醌陰離子反應(yīng)。然后,氧化N2簇接受來自氫氣的電子被還原。在反應(yīng)(3),質(zhì)子化中性半醌最終仍被還原成氫醌。
這里描述的假說中,氫氣在兩個方向上,分別以提供電子的還原劑和提供質(zhì)子的氧化劑整頓電子流動方向,和各種醌分子反應(yīng)將半醌變成氫醌。這個反應(yīng)能避免電子傳遞鏈向病理死胡同發(fā)展,減少缺血再灌注損傷的發(fā)生。氫氣中間電位低于NADH Em 320 mV,熱力學(xué)上有向NADH逆向傳遞電子的可能。兩個方向的電子流動能減少缺血再灌注的氧化爆發(fā)風(fēng)險,一是還原醌中間體為醌,二是給氧化N2簇提供電子,隨后電子經(jīng)過鐵硫簇傳遞給氧化FMN或/和還原NAD+為NADH。通過氫氣的正向電子流動,醌中間體被還原為氫醌,這將能減少醌池內(nèi)半醌自由基產(chǎn)生超越陰離子的水平。
逆向電子首先被氧化N2簇接受,接受電子的是PH依賴氧化還原N2簇。氫氣的氧化還原能可被還原不穩(wěn)定醌中間體部分消耗,如果N2的Em高于鐵硫簇~250 mV,根據(jù)氧化還原玻爾效應(yīng),部分能量也可被N2利用,N2簇有更高的Em(-150 mV)。相反在沒有醌中間體和膜電位提供的質(zhì)子梯度,低Em N2簇可與氫氣發(fā)生反應(yīng)。
除了在催化中心分解氫氣,另外一個可能位點是氫氣在醌室口頸部,這里分布著Arg71、Arg274和 hydroxy-Arg77等堿性氨基酸,羥基精氨酸是精氨酸的氧化中間體,在一氧化氮合成過程精氨酸被氧化產(chǎn)生,隨后變成亞硝酸和瓜氨酸。失活態(tài)時最狹窄部位直徑為1.9-2.2 Å,醌頭的寬度為6 Å。這樣醌頭部被鎖定在醌室深部N2催化位。在失活態(tài)或通道未完全開放時,醌頭部必須穿越狹窄部分,這個過程可碾壓氫氣分子,有可能會通過類似FLP機(jī)制激活氫氣。這涉及醌頭部催化活性、精氨酸堿性基親質(zhì)子和羥基精氨酸的供質(zhì)子體。這個狹窄部位靠近SQNs,可通過EPR檢測出慢弛豫信號,SQNs和N2 簇間距離為30Å。

圖1氫氣在醌室內(nèi)激活的模式圖。
l 黃色箭頭相反指向代表氫氣激活后兩個電子超不同方向傳遞。
l 紅色箭頭代表氫氣提供質(zhì)子(氫離子)。
l 淡橙色框代表醌室(活性中心),醌的基本結(jié)構(gòu)包括苯醌頭部和類異戊二烯尾,苯醌是含有兩個羰基的苯環(huán),Q是醌英文的縮寫簡稱。醌中間體有多種類型,最基本的有醌,半醌,氫醌。
l 紅實心圓代表堿性氨基酸,是復(fù)合物I催化功能的基礎(chǔ)結(jié)構(gòu)。
l 黑空心圓代表酪氨酸殘基,是N2電子傳遞的必須結(jié)構(gòu)。
l 藍(lán)色大橢圓范圍包含復(fù)合物I參與氫氣激活的相互作用過程。
l 雙藍(lán)色圓代表氫氣分子。
l Q室內(nèi)藍(lán)色箭頭代表醌中間體活動對氫分子的研磨(碾壓)。

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